La Asamblea General, está compuesta por representantes de las empresas asociadas, es el órgano máximo de gobierno en ANDEIS.
La Junta Directiva es el órgano de gobierno, gestión y representación de la Asociación, la composición actual (mandato 2017-2021) es la siguiente:
- PRESIDENTE : Francisco Javier Granja , AVANZA (Sevilla)
- VICEPRESIDENTE 1º : Juan Carlos Parada , EQUA INSERCIÓN (Cádiz)
- VICEPRESIDENTE 2º : José Manuel González , SUPLÁ (Córdoba)
- TESORERÍA : Clara Peñuela, ECOSUR (Jaén)
- SECRETARÍA : Javier Alcaide, SERVICIOS PARA INTEGRACIÓN (Málaga )
- VOCAL : Alfonso Padilla, ALDABA 21 (Córdoba)
- VOCAL : Montserrat López , NUFAN (Cádiz) )
- VOCAL : Nancy Alfaro , FACILITA SERVICIOS SALUDABLES (Antequera, Málaga)